University of Ottawa

Objet publié

Les motifs sont des sites structuraux actifs qui remplissent des fonctions biologiques utiles et qui peuvent servir à la création de nouveaux vaccins et de nouvelles enzymes. L’une des étapes cruciales de la conception de protéines est la création d’échafaudages stables capables de supporter les motifs pour ainsi en maintenir la forme et, par conséquent, la fonction. Malheureusement, les techniques actuelles fondées sur l’apprentissage automatique sont chronophages et restreintes aux petites protéines, ce qui en limite l’utilité. Le projet vise précisément à simplifier le procédé de conception en mettant rapidement à la disposition des chercheurs des échafaudages d’une grande qualité tout en réduisant considérablement le temps nécessaire à leur création. Cette rapidité est un atout particulièrement important lorsqu’il devient urgent de mettre en œuvre des mesures requises pour faire face aux maladies émergentes qui évoluent rapidement. Nous aurons recours à cette fin aux avancées récentes réalisées en matière de modélisation de la diffusion, d’apprentissage géométrique profond, de modèles graphiques et de réseaux.